Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
XIRP1Q702N8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XIRP1Q702N8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms