Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC73Q6ZRK6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms