Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUX4L9Q6RFH8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms