Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN1Q6NZI2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms