Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms