Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms