Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LEMD1Q68G75 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms