Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRCH2Q5VUJ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms