Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIVEP3Q5T1R4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms