Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP70Q5T0N1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms