Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FRMPD1Q5SYB0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FRMPD1Q5SYB0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FRMPD1Q5SYB0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FRMPD1Q5SYB0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FRMPD1Q5SYB0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FRMPD1Q5SYB0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FRMPD1Q5SYB0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FRMPD1Q5SYB0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms