Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C10orf55Q5SWW7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C10orf55Q5SWW7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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