Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CEP170Q5SW79 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CEP170Q5SW79 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CEP170Q5SW79 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms