Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms