Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3KQ59H18 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms