Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms