Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDLIM3Q53GG5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms