Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LONRF3Q496Y0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LONRF3Q496Y0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms