Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS9Q3SYG4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms