Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms