Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC27Q2M243 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms