Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK2Q16620 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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