Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC18A3Q16572 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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