Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRY1Q16526 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms