Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC2Q16515 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms