Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNXAQ16473 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms