Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF56Q15929 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms