Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS72Q15906 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS72Q15906 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS72Q15906 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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