Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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