Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC85BQ15834 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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