Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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