Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TAF1AQ15573 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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