Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1CQ15572 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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