Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEC23BQ15437 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms