Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 SEC31A-210ENST00000503058 706 ntTSL 55.57□□□□□ -1.523e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.926e-8■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PTGES2-212ENST00000496594 2103 ntTSL 520.3■□□□□ 0.846e-8■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PTGES2-211ENST00000493205 1514 ntTSL 517.41■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.316e-8■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.146e-8■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PTGES2-205ENST00000476655 1063 ntTSL 314.9□□□□□ -0.026e-8■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 TECPR1-208ENST00000471397 774 ntTSL 318.14■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 TECPR1-209ENST00000472845 551 ntTSL 512.9□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 CSAG3-202ENST00000617158 789 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.563e-13■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.423e-13■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.553e-13■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 CLSTN1-203ENST00000435891 3829 ntTSL 210.19□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 ATP1A1-202ENST00000369494 698 ntTSL 38.14□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 SLC2A9-206ENST00000505104 1659 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 SLC2A9-213ENST00000513129 738 ntTSL 39.27□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 SUGP2-213ENST00000600239 5565 ntTSL 213.31□□□□□ -0.282e-11■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.32e-11■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 SUGP2-209ENST00000597280 814 ntTSL 312.73□□□□□ -0.372e-11■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 THOP1-208ENST00000587468 671 ntTSL 216.82■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PPIA-209ENST00000494484 2149 ntTSL 210.02□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PPIA-205ENST00000479021 552 ntTSL 49.34□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PPIA-202ENST00000415933 863 ntTSL 28.36□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PPIA-207ENST00000481437 570 ntTSL 26.09□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 414.94□□□□□ -0.026e-16■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 213.14□□□□□ -0.316e-16■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 47.67□□□□□ -1.186e-16■■■■■ 34.3
SF3B4Q15427 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PCBP2-204ENST00000439930 1296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 59.82□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PCBP2-223ENST00000552819 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GSN-214ENST00000485767 6454 ntTSL 1 (best)9.94□□□□□ -0.826e-9■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 ESPL1-209ENST00000553219 714 ntTSL 211.1□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 ESPL1-207ENST00000552671 6665 ntTSL 210.94□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 ESPL1-201ENST00000257934 6623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.322e-12■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.422e-12■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.832e-12■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PHC3-216ENST00000497171 420 ntTSL 23.39□□□□□ -1.872e-12■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PHC3-210ENST00000484931 657 ntTSL 53.05□□□□□ -1.922e-12■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.326e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.796e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.976e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 38.65□□□□□ -1.026e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 27.92□□□□□ -1.146e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 37.43□□□□□ -1.226e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.226e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 36.05□□□□□ -1.446e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 25.53□□□□□ -1.526e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.546e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 54.97□□□□□ -1.616e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.86e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.27□□□□□ -1.896e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.986e-25■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 RAB24-203ENST00000393610 870 ntTSL 515.54■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PABPC1-223ENST00000523636 818 ntTSL 54.55□□□□□ -1.683e-16■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.744e-9■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.634e-9■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.224e-9■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 AGRN-204ENST00000466223 459 ntTSL 214.45□□□□□ -0.12e-11■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.794e-10■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 ASB1-203ENST00000438264 1048 ntTSL 316.2■□□□□ 0.184e-10■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.114e-10■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 ASB1-209ENST00000491653 818 ntTSL 212.24□□□□□ -0.454e-10■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 ASB1-204ENST00000463352 569 ntTSL 311.45□□□□□ -0.584e-10■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 CARM1-205ENST00000586508 1050 ntTSL 215.36■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 SRSF11-215ENST00000486667 662 ntTSL 59.05□□□□□ -0.965e-12■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 CAD-205ENST00000458503 806 ntTSL 514.27□□□□□ -0.136e-10■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 PPIA-206ENST00000480603 842 ntTSL 37.48□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 TRNAU1AP-209ENST00000495995 2040 ntTSL 215.92■□□□□ 0.143e-12■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 RNF44-205ENST00000508478 662 ntTSL 314.81□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 34.2
SF3B4Q15427 SSBP4-207ENST00000600244 622 ntTSL 216.15■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 34.1
SF3B4Q15427 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 34.1
SF3B4Q15427 RECQL4-202ENST00000524998 686 ntTSL 318.13■□□□□ 0.497e-17■■■■■ 34.1
SF3B4Q15427 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.552e-11■■■■■ 34.1
SF3B4Q15427 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)18.23■□□□□ 0.512e-11■■■■■ 34.1
SF3B4Q15427 TTLL3-214ENST00000431204 1041 ntTSL 510.72□□□□□ -0.692e-11■■■■■ 34.1
SF3B4Q15427 FLNA-215ENST00000474358 696 ntTSL 216.07■□□□□ 0.161e-10■■■■■ 34.1
SF3B4Q15427 FLNA-209ENST00000444578 843 ntTSL 315.34■□□□□ 0.051e-10■■■■■ 34.1
SF3B4Q15427 NCOR2-216ENST00000461081 2910 ntTSL 216.77■□□□□ 0.278e-10■■■■■ 34.1
SF3B4Q15427 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.75e-7■■■■■ 34.1
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