Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B3Q15393 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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