Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-1Q15270 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX1-1Q15270 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
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