Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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