Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCOLCEQ15113 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms