Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3GAP1Q15042 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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