Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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