Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP1BQ14684 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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