Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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COL9A2Q14055 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A2Q14055 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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