Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE7AQ13946 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7AQ13946 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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