Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDX39BQ13838 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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