Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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ITGA9Q13797 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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ITGA9Q13797 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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ITGA9Q13797 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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ITGA9Q13797 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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ITGA9Q13797 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA9Q13797 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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