Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALKBH1Q13686 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALKBH1Q13686 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms