Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CUL4BQ13620 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL4BQ13620 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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