Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PICALMQ13492 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PICALMQ13492 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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