Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2V1Q13404 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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UBE2V1Q13404 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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UBE2V1Q13404 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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UBE2V1Q13404 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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UBE2V1Q13404 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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UBE2V1Q13404 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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UBE2V1Q13404 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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UBE2V1Q13404 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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UBE2V1Q13404 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UBE2V1Q13404 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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UBE2V1Q13404 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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